I Shadow Quest levde tre små häxor lyckligt tillsammans men efter en tid kom ett monster och ville ta deras makt .om de vägrade att göra det tog monstret en av häxorna med sig.därför gick en liten häxa för att hämta sin vän. Huvudsyftet i det här spelet är att slutföra nivån.du måste hitta dörren för att gå till nästa nivå (som är inställd i slutet av nivån).under crossover måste du möta många hinder som spikar, automatisk kanon och andra varelser.